「ヴァルキリープロファイル」は北欧神話をモチーフとした独特の世界観をベースに、人間の死と神々の存在を描いた重厚なストーリーが根幹となっています。
本作では人間の視点から見た人と神の物語 ―神への復讐― を軸に物語が進み、サブタイトルともなっている「咎」がストーリーにもシステムにも深く関わっていきます。
また、もうひとつの魅力である「戦略的」で「爽快」なバトルもシステムも健在です。

ヴァルキリープロファイルシリーズのバトルを継承し、ボタン1つで攻撃をしかけ、キャラクター同士のコンボを決めることができる爽快なバトルは健在。本作ではクォータービューで描かれる。

味方キャラクターとのコンボを決め、ゲージが満タンになるとソウルクラッシュモードに突入！ボタン1つでキャラクターたちが迫力の必殺技を繰り出します。

敵との接触の仕方によって、仲間キャラクターが戦闘に自動的に参戦してくれるシステム。キャラクターたちは敵と接触した方向に対しどの位置にいたのかでそれぞれ参戦してくれる方角が異なり、それによって敵を4方から囲むことも可能！

敵とバトルに突入する際、ミューチュアルアシストシステムをうまく利用して4人が参戦すると、そのときの敵の位置に対する味方キャラクターの位置によって陣形が組まれることがある。
このアクティブフォーメーションには、いくつか陣形の種類があり、バトルに突入した際にフォーメーションが発動するとその時の陣形に合わせたボーナスが発生する。

本作は、物語全体が1つ1つの異なる物語をいくつも紡いでいくチャプター形式で話が進行していき、主人公ウィルフレドがそれぞれの物語にどう関わっていくかが描かれます。ウィルフレドがどういった行動をしていくかでストーリーやゲーム自体に変化が表れていき、最終的にいくつかの結末が用意されています。
また、各チャプターごとにメインとなるサブキャラクターを中心とした、キャラクター一人ひとりの人物に寄ったストーリーで物語が展開されます。
そのため、「ヴァルキリープロファイル -レナス-」のように1人のサブキャラクターの側面や由来について深く知ることができ、仲間となるキャラクターたちに感情移入することができます。さらに、仲間となるキャラクターたちは全キャラに複数のフェイス＆ボイスが用意されています。

プレイヤーの判断で様々に進行していくゲームのストーリー。
それに合わせて、どういった行動をとってきたかで主人公ウィルフレドの性格にも変化が…！？
狂気的な性格になったり、他人に対する思いやりの気持ちを持った性格にも変化する。

「女神の羽」とは、父セオドールの形見である、戦乙女の羽です。
その羽に冥界の女王ヘルが与えた力を、バトルの際に使用することができます。
「女神の羽」を使用されたキャラクターは、潜在能力を限界以上まで引き出して行使することができ、その強大な力を持ってすれば立ちふさがるボスクラスの敵をも一瞬のうちに倒すことができるようになります。「女神の羽」とは、“必ず戦いに勝利できる力”を与えてくれる、いわゆるバランスブレイカーとも言える究極の切り札です。

女神の羽の代償
しかし、女神の羽によって強力な力を得たキャラクターは、その代償として命を失います。羽の力によって死亡したキャラクターは、そのバトルの終了後に特殊なイベントが発生し、その後は物語に一切登場することはなく、文字通り死亡します。
ウィルフレドは、仲間の命を犠牲にする「女神の羽」の力を理解した上で、本当に自らの復讐のためだけにその力を行使すべきなのか、悩みながら物語を紡いでいきます。
こういったバトル中での行動は物語や彼の性格に大きく影響を与えていきます。
こうして、自己の目的のためだけに人の命を犠牲にした“咎”がウィルフレドの持つ羽を黒く染めてゆき、神に対抗するための力として蓄えられていきます。